Все относительно просто. В HunterTik автозагрузка необходимых скриптов находится тут — /tik/etc/rc.d/run.d/ Там вы увидите множество скриптов для загрузки необходимого в HunterTik. Опытным путем подберите ту очередность, которая сработает. Начните с S09huntertik.
У меня samba стартовала, но потом почему то не работало и помогло только это :
S10samba
#!/bin/bash
echo "Starting Samba server"
chroot /linux /etc/init.d/samba restart