При работе приложения начали возникать существенные задержки, местами вообще отказы. Надо было посмотреть как работает MySQL база.
Все свелось к использованию tcpdump и анализатора запросов pt-query-digest. Потому как останавливать базу нельзя, а лог запросов там, конечно же, выключен.