Здравствуйте!
Есть подобная проблема с UB 0.7.3 rev 4912.
Тем не менее могу точно сказать, что проблема проявила себя после того как был добавлен NAS/Mikrotik для подсети, у которой уже был свой NAS.
Так же стоит отметить, что после перезагрузки UB (/etc/rc.d/billing restart) правила прописываются нормально, но проблема все равно актуальна.
Правила перестали записываться и в другие NAS типа Mikrotik. Проблем с NAS другого типа не обнаружено - других типов NAS в системе нет.