Друзья, всем спасибо
Похоже что проблема найдена и она не в настройках Микротика. В ходе нашего общения появилась мысль, что по какой то причине route в сервере прописан не верно.
После этой команды на Win Server все заработало:
route add 172.16.1.0 MASK 255.255.255.0 172.16.2.1
Получается что Микротик все это время отрабатывал исправно ?. А вот сервер из-за отсутствия роута ответить на RDP-подключение не мог. Вот такая вот петрушка.